An der Fakultät Architektur und Urbanistik existieren drei Institute: Institut für Europäische Urbanistik (IfEU), Bauhaus-Institut für Geschichte und Theorie der Architektur und Planung (Bauhaus-Institut), bauhaus-institut für experimentelle architektur (bauhaus.ifex).
Die drei Institute stehen für die Forschungsfelder an der Fakultät, in denen es um Fragen der zukunftsfähigen Entwicklung von Architektur, Stadt und Landschaft geht. Im Forschungsschwerpunkt »Planen.Bauen.Erben« sind die Heritage-, Wohnungs-, Nachhaltigkeitsforschung bzw. sozial-ökologische Transformation sowie digitale Transformation zusammengefasst. Forschungsprojekte der Fakultät werden auch an das Internationale Heritage Zentrum (IHZ), das fakultätsübergreifend die Kulturerbe-Forschung, -Lehre und -Vermittlung koordiniert, angebunden. Die Institute kooperieren darüber hinaus in unterschiedlicher Weise mit weiteren Partnerinstitutionen.
Institutionellen Charakter hat zudem das 2015 von Bauhaus-Universität Weimar und Ehtiopian Institute of Architecture, Building Construction and City Development gegründete, vom Deutschen Akademischen Austauschdienst geförderte, Emerging City Lab Addis Ababa. Als Zentrum, das Forschung und Lehre beider Institutionen miteinander vernetzt, widmet es sich dem Kontext dynamischer Wandlungsprozesse auf dem afrikanischen Kontinent.
Das gemeinsam vom Ehtiopian Institut of Architecture, Building Construction and City Development (EiABC) und Bauhaus-Universität Weimar gegründete Emerging City Lab soll sich als Forschungs- und Lehrzentrum zu Fragestellungen zu Bau und Planung von emerging cities etablieren.